AutoDock是一款开源免费分子对接软件，广泛用于计算机辅助药物设计，用来预测小分子与生物大分子之间的结合姿态与结合自由能。
核心模块
AutoGrid：预处理程序。预先在受体结合口袋区域生成原子亲和力网格，提前计算不同原子类型在空间上的范德华力、静电、去溶剂化作用，加速后续对接能量计算。
AutoDock：核心对接计算程序，执行构象搜索、能量评估。
AutoDockTools：配套图形界面工具，用于蛋白配体预处理、设置对接盒子、导出输入文件、对接结果可视化与构象分析。
主要功能
预测小分子在蛋白口袋内的最优结合构象；
计算结合自由能 ΔG、理论抑制常数 Ki，评估分子亲和力；
构象聚类，对多次对接结果分组，筛选优势构象；
分析氢键、疏水作用等分子间相互作用；
批量小分子虚拟筛选，筛选潜在活性先导化合物。
下载地址
https://pan.xunlei.com/s/VOjpRAyregHB_D2syKyADAs5A1?pwd=njd6#
安装教程
正文完
